MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET35

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010696	GATT	2	8	1594	1601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010696	ACT	2	6	1740	1745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010696	AAG	2	6	3281	3286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010696	TA	3	6	3305	3310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010696	CAT	2	6	13498	13503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010696	AGG	2	6	13542	13547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010696	TATG	2	8	13548	13555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010696	TCT	2	6	13584	13589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010696	CTA	2	6	17336	17341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010696	T	9	9	17866	17874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010696	A	9	9	17877	17885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010696	TAC	2	6	17896	17901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010696	GTT	2	6	17943	17948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010696	TAA	2	6	18012	18017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010696	ATTGT	2	10	18018	18027	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010696	A	7	7	18858	18864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010696	ATA	2	6	18941	18946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010696	CTT	2	6	18957	18962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010696	CAA	2	6	18969	18974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010696	TAT	2	6	19053	19058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010696	G	6	6	19416	19421	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010696	C	7	7	19427	19433	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_010696	AT	4	8	20018	20025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010696	GAT	2	6	20509	20514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010696	TAA	2	6	20515	20520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010696	A	6	6	20519	20524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010696	GGA	2	6	20617	20622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010696	AAAAT	2	10	20795	20804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010696	ATG	2	6	20807	20812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010696	A	8	8	20821	20828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010696	ATA	2	6	20935	20940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010696	ACT	2	6	20950	20955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010696	CTTT	2	8	21035	21042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010696	TTA	2	6	21053	21058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010696	AGG	2	6	21102	21107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010696	ATC	2	6	21130	21135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010696	ACAAA	2	10	21173	21182	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010696	TCAT	2	8	21199	21206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010696	T	6	6	21216	21221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010696	TCCCC	2	10	21225	21234	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
41	NC_010696	TGAAA	2	10	21541	21550	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010696	A	6	6	21548	21553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010696	GCC	2	6	21558	21563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010696	TAA	2	6	21568	21573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010696	ACCGC	2	10	21685	21694	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_010696	AGCGA	2	10	21717	21726	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010696	GAAC	2	8	21728	21735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010696	GAG	2	6	21745	21750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010696	CAG	2	6	21978	21983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010696	AG	3	6	21998	22003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010696	ATC	2	6	22038	22043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010696	AGC	2	6	22070	22075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010696	ATCA	2	8	22108	22115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010696	GTT	2	6	22197	22202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010696	CCCCG	2	10	22215	22224	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
56	NC_010696	CAC	2	6	22243	22248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010696	TA	4	8	22391	22398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010696	TAG	2	6	22409	22414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010696	CAAC	2	8	22439	22446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010696	T	7	7	22487	22493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010696	ACA	2	6	22511	22516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010696	ACCTA	2	10	22548	22557	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_010696	ATT	2	6	22679	22684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010696	A	6	6	22712	22717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010696	TAG	2	6	26873	26878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010696	AGA	2	6	26891	26896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010696	A	7	7	26955	26961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010696	T	8	8	28347	28354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010696	GCTG	2	8	28969	28976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010696	ATTGT	2	10	29380	29389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010696	TAAT	2	8	29403	29410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010696	T	8	8	29431	29438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010696	AAG	2	6	29442	29447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010696	CT	3	6	30189	30194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010696	A	6	6	30200	30205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010696	GAT	2	6	31246	31251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010696	A	7	7	31320	31326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010696	GCA	2	6	31333	31338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010696	GTT	2	6	31340	31345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010696	TCC	2	6	31668	31673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010696	TTA	2	6	31743	31748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010696	A	6	6	31759	31764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010696	CCG	2	6	31766	31771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010696	A	7	7	32143	32149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010696	TA	3	6	32170	32175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010696	CGG	2	6	32517	32522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010696	TC	3	6	33121	33126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010696	A	6	6	34533	34538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010696	ATG	2	6	34559	34564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010696	CTTGC	2	10	34581	34590	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010696	ATA	2	6	34592	34597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010696	AT	3	6	34636	34641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010696	T	8	8	34653	34660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010696	CT	4	8	34689	34696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010696	CTT	2	6	34712	34717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010696	CGC	2	6	34821	34826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010696	A	6	6	34894	34899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010696	ATT	2	6	34935	34940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010696	T	6	6	34954	34959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010696	T	6	6	34961	34966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010696	TA	3	6	34988	34993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010696	ATG	2	6	35074	35079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010696	AAT	2	6	35095	35100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010696	ATG	2	6	35147	35152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010696	TAT	2	6	35257	35262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010696	GGTTCT	2	12	35277	35288	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_010696	GTTC	2	8	35312	35319	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010696	A	7	7	35368	35374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010696	A	6	6	35465	35470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.